Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms