Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms