Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Usf3B2RUQ2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Usf3B2RUQ2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Usf3B2RUQ2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Usf3B2RUQ2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms