Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms