Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf2A3KGV1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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