Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tubb1A2AQ07 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tubb1A2AQ07 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tubb1A2AQ07 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tubb1A2AQ07 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tubb1A2AQ07 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tubb1A2AQ07 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tubb1A2AQ07 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubb1A2AQ07 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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