Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syndig1A2ANU3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms