Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lcn6A2AJB9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms