Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms