Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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