Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vamp5Q9Z2P8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms