Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms