Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Cldn8Q9Z260 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn8Q9Z260 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn8Q9Z260 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn8Q9Z260 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn8Q9Z260 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn8Q9Z260 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn8Q9Z260 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn8Q9Z260 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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