Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nme3Q9WV85 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nme3Q9WV85 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms