Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmfrQ9R049 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms