Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms