Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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