Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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