Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prg4Q9JM99 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prg4Q9JM99 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prg4Q9JM99 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Prg4Q9JM99 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms