Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms