Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfcp2Q9ERA0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms