Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clstn1Q9EPL2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms