Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop7Q9DCH2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms