Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms