Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Syce1Q9D495 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Syce1Q9D495 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Syce1Q9D495 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Syce1Q9D495 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Syce1Q9D495 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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