Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms