Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem88Q9D0N8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms