Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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