Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms