Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms