Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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