Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Use1Q9CQ56 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Use1Q9CQ56 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Use1Q9CQ56 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Use1Q9CQ56 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms