Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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