Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms