Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms