Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms