Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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