Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim7Q923T7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim7Q923T7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim7Q923T7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim7Q923T7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim7Q923T7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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