Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms