Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CcsapQ8QZT2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms