Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LgsnQ8CIX8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms