Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms