Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Pramef8Q8CE24 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Pramef8Q8CE24 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Pramef8Q8CE24 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Pramef8Q8CE24 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Pramef8Q8CE24 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pramef8Q8CE24 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pramef8Q8CE24 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms