Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpcpd1Q8C0L9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpcpd1Q8C0L9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpcpd1Q8C0L9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpcpd1Q8C0L9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms