Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms