Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms