Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms