Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M10.3Q85ZW6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms