Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms