Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms